基于单细胞测序探索SENP2在肾癌不同亚型中的作用

本研究基于单细胞测序数据探讨SENP2在肾细胞癌三种不同亚型中的表达差异和作用机制。通过R语言进行UMAP降维可视化和差异表达基genetic privacy因(differentially expressed genes,DEGs)的筛选;对DEGs进行功能注释和富集分析并进行PPI网络构建,通过Cytoscape软件筛选关键基因;通过分析SENP2的表达差异与三种RCC亚型患者生存预后和临床分期的关系,揭示其在不同亚型中的作用;通过分析SENP2及其互作基因的相关性,探索SENP2引起三种不同RCC亚型患者生存预后和临床分期差异性的调控selleckchem机制;最后,对肾透明细胞癌(Kidney renal clear cellcarcinoma,KIRC)中的SENP2进行免疫组化实验。本研究结果表明,RCC三种亚型中的基因表达具有差异性;RCC三种亚型中差异表达基因显著富集于细胞增殖、蛋白质代谢、细胞衰老以及TP53调节等生物学过程中;筛选Hub基因锁定SENP2;生存分析和临床分期分析结果表明,在KIRC中,随着临床分期的增加,SENP2表达量逐渐减少,患者的生存预后变差,在肾嫌色细胞癌(Kidney Chromophobe,KICH)中,SENP2表达与患者的生存预后成正相关,与临床分期没有相关性,在肾乳头状细胞癌(Kidney renal papillary cellcarcinoma,KIRP)中SENP2表达与患者的生存预后成负相关,SENP2表达越高,患者的预后越差,与临床分期没有相关性;SENP2及其互作基因相关性研究表明,在KIRC和KICH中,SENP2正相关调控抑癌基因TP53,而在KIRP中,SENP2负相关调控TP53家族成员TP73,进而导致SENP2调控RCC三种亚型的差异性;免疫组化结果显示SENP2在KIRC呈现低表达且与年龄、性别和Raf抑制剂肿瘤大小无关。综上所述:SENP2通过不同调控机制参与了RCC三种亚型的发生和发展,有望成为判断RCC的肿瘤标志物,为相关机制研究提供了新思路。