头颈部鳞状细胞癌铁死亡相关lncRNA预后模型的建立与验证

目的 研究头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)铁死亡相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRABT-199体内NA)并构建相关的HNSCC预后模型。方法 癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取HNSCC的RNA高通量转录组数据,FerrDb数据库获取和铁死亡相关基因,并基于HNSCC中铁死亡相关差异表达的lncRNA构建HNSCC预后的多lncRNA模型。结果 共获得246个HNSCC铁死亡相关基因和1 328个铁死亡相关lncRNA;通过单因素Cox回归分析、LASSO回归及多因数Cox回归分析共筛选得到72个具有独立预后意义的lncRNA构建HNSCC预后模型(均P<0.05)。Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险组和低风险组的总生存率比较,差异具有统计学意义(PPidnarulex分子量<0.01)。1、2和3年受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积分别为0.741、0.739和0.738。结论 通biliary biomarkers过生物信息学方法筛选出72个影响HNSCC预后的铁死亡相关lncRNA,并成功构建预后风险模型,这72个铁死亡相关的lncRNA可能是HNSCC预后的分子生物标志物和治疗靶点。