地西他滨通过BIM基因对T细胞淋巴瘤增殖的影响及其相关机制的研究

目的探究BIM基因在T细胞淋巴瘤中的甲基化模式,以及地西他滨(Decitabine,DAC)对PTCL细胞中细胞增殖及BIM基因表达的影响。方法1、通过生物信息学方法筛选目的基因及细胞株,相关生物信息学分析所用数据由GEO(Gene Expression Omnibus)平台获取;在Cytoscape软件进行计算,以筛选目的基因。利用人类蛋白质图谱数据库(The Human Protein Atlas,HPA)根据基因mRNA水平筛选细胞株。2、选取临床患者骨髓活检标本,包括外周T细胞淋巴瘤(PTCL)16例,正常对照10例,正常组为除恶性肿瘤的淋巴结反应性增生患者,采用甲基化特异性PCR(Mwww.selleck.cn/products/CisplatinSP)方法检测患者BIM基因甲基化水平,收集PTCL患者的临床资料,探究BIM基因甲基化是否与某些临床特征相关,包括性别、年龄、分期、分型等方面。3、CCK-8法检测细胞增殖情况,采用CCK-8法检测(0、2.5、5、10、25、50、100、200)μM地西他滨处理Hut-78和Jurkat细胞24、48、72h后,上述细胞吸光度值的改变情况,计算增殖抑制率,以筛选最佳处理浓Medications for opioid use disorder度及时间。4、将HLorlatinib分子式ut-78和Jurkat细胞分别分为对照组、地西他滨处理组,并设置阳性对照和阴性对照;MSP与qMSP法检测地西他滨处理对细胞中BIM基因的甲基化水平的影响。5、将Hut-78和Jurkat细胞分别分为对照组、地西他滨处理组,Western Blot法检测地西他滨处理对细胞中BIM基因蛋白水平的影响。6、将Hut-78和Jurkat细胞分别分为对照组、地西他滨处理组,qRT-PCR法检测地西他滨处理对细胞中BIM基因mRNA水平的影响。结果1、通过公开的数据集筛选数据找到了外周T细胞淋巴瘤潜在的新的分子标志物BIM。在HPA数据库中根据BIM mRNA水平筛选出Hut-78和Jurkat细胞。2、BIM基因在PTCL患者中表现出更高的甲基化频率,与正常对照组相比有明显的差异,结果具有统计学意义。BIM基因甲基化模式与所收集的PTCL患者临床特征间无明显联系,可能与样本例数少有关。3、CCK-8检测细胞增殖活性结果示,地西他滨呈浓度和时间依赖性抑制Hut-78和Jurkat细胞的增殖。上述细胞经地西他滨处理48h,在200μM时达到半数抑制浓度。4、MSP与qMSP结果显示,BIM在Hut-78和Jurkat细胞中呈现高甲基化状态,经地西他滨处理后,能明显降低BIM基因启动子的甲基化水平。5、Western Blot结果显示,经地西他滨处理后,与对照组相比,BIM蛋白表达上调,结果有统计学意义。6、qRT-PCR结果显示,经地西他滨处理后,与对照组相比,BIM mRNA表达水平增加,结果有统计学意义。结论1、PTCL患者中BIM基因甲基化水平较高;2、地西他滨能够诱导BIM基因发生去甲基化,并上调BIM蛋白和mRNA的表达水平。